L’Europe a attribué au Canal Seine-Nord Europe une nouvelle enveloppe de financement à hauteur de 300 millions d’euros au titre du Mécanisme d’interconnexion en Europe (MIE). 
 
Au titre de l’appel à projet lancé à l’automne 2023, la Commission européenne, après approbation par les Etats membres, a attribué 300 millions d’euros à la liaison Seine-Escaut pour la poursuite des travaux du Canal Seine-Nord Europe. Après les 405 millions d’euros attribués pour l’essentiel pour les travaux du secteur 1 (de Compiègne à Passel dans l’Oise), cette enveloppe de 300 millions d’euros va permettre d’engager les travaux sur le secteur 2. L’évaluation de l’Europe va de pair avec l’avis favorable de la commission d’enquête sur l’enquête publique environnementale des secteurs 2 à 6 (de Passel dans l’Oise à Aubencheul-au-Bac dans le Nord).
 
Avant l’obtention de cette dernière subvention, le projet du Canal Seine-Nord Europe a bénéficié de trois financements de la part de l’Europe - 14 millions d’euros perçus par VNF et fléchés vers le CSNE pour la période 2007-2013,
- 163 millions d’euros dans le cadre du MIE1 pour des dépenses allant de 2014 à 2023
- 405 millions d’euros dans le cadre du MIE2 pour les dépenses allant de 2024 à 2027